La temporada 2019-20 disputa su tercera Liga Europa de la UEFA gracias al quinto puesto alcanzado la temporada anterior. La situación se hace insostenible y Michel es destituido ocupando su lugar Quique Sánchez Flores que vuelve por tercera vez a entrenar al Getafe. 7 partidos restantes. El equipo consigue la permanencia en la última jornada contra el Real Valladolid Club de Fútbol en el Estadio José Zorrilla consiguiendo un empate a 0 que a su vez condenaría al equipo local al descenso. Iker se formó en la cantera del Real Madrid CF donde estuvo desde 2009 hasta 2012, cuando se incorporó a las categorías inferiores del Manchester City a la edad de 12 años. Teñirse de azul del grupo heavy de Getafe Discípulos de Salieri. Sus patrocinadores principales, a lo largo de los años, han sido: Puertas Visel, Sacresa, Centro Comercial Opción, P.S.G., Grupo Galcó, Burger King, CONFREMAR y Tecnocasa.
Al finalizar la temporada, con 31 años, se retiró del fútbol profesional. Aparte del himno oficial existen varias canciones de grupos musicales, que son homenaje al Getafe Club de Fútbol y que son utilizadas como himnos alternativos del equipo. Deportivamente, durante esta etapa, el equipo se instala en la zona media de la clasificación con la excepción de las temporadas 2002-03 y 2005-06 en las que se roza el descenso y la 2004-05, en la que se acaba a un punto de acceder a la Liga de Campeones de la UEFA, con Miguel Ángel Lotina en el banquillo. En su participación en la Liga finaliza en octavo puesto con 54 puntos (14V 12E 12D) fuera de los puestos que permitían la participación europea aun estando entre los puestos 3º y 7º desde las jornadas 13 a la 37 de la temporada. La temporada se inicia nuevamente de manera irregular con falta de jugadores en puestos claves o la incorporación a finales de agosto de fichajes como el de Omar Alderete o Munir El Haddadi.
En el capítulo de fichajes es reseñable el alta de Enes Ünal en el mercado estival y la cesión de Carles Aleñá en el mercado de invierno, y las bajas de Jorge Molina y Vitorino Antunes. En la temporada 2018-19 se fichan a David Soria, Vitorino Antunes, Nemanja Maksimović y Jaime Mata. Jaime Mata inauguró el marcador a favor del Getafe y, posteriormente Danilo Pereira da Silva y Mathias Olivera en propia puerta marcaron a favor del Ajax. En la Copa del Rey se consigue llegar hasta cuartos de final, siendo eliminado por el Valencia C.F. La eliminatoria de 1/8 de final debía disputarse frente el Inter de Milán a doble partido, pero a causa de la pandemia de covid19 fue aplazado hasta el 5 de agosto de 2020 a partido único a puerta cerrada en el Arena AufSchalke en Alemania. Los primeros años en 2ªB registraron altibajos hasta que el Numancia se estabilizó en esa categoría que ya aparecía en los marcadores de los programas de radio y de los periódicos. La temporada 1986-87 la RFEF introdujo una nueva categoría superior a la Liga Nacional Juvenil, la llamada Superliga Juvenil, formada por un grupo único con los 16 mejores equipos juveniles del país, a imagen y semejanza de la Primera División del fútbol profesional.
Sin embargo, en su retorno a la máxima categoría del fútbol español, Osasuna decepcionó y regresó al término de la competición a Segunda División. Fue el portero titular de la selección durante el torneo, destacando actuaciones como la del partido de semifinales contra la selección francesa de Pogba, en el que tras el 3-3 con el que concluyó la prórroga, detuvo dos penaltis a Umtiti y a Kondogbia, clasificando a España para la final. ↑ El partido de vuelta de la eliminatoria entre Inter de Milán y FC Porto se disputó el 15 de marzo de 2005 para evitar el incumplimiento de la normativa de la UEFA que prohíbe la disputa de dos partidos en un mismo estadio en la misma jornada europea, ya que el Inter comparte estadio con el Milan, quien también jugaba la vuelta de su eliminatoria como local. La eliminatoria se disputa contra el Ajax de Ámsterdam, mejor tercero de la fase de grupo de la Liga de Campeones de la UEFA, a doble partido. El 4 de febrero de 2009 debutó en un partido amistoso contra Japón. El 8 de septiembre, hizo su debut en el amistoso contra Panamá. Para su sutitución se contrata a Míchel González que retorna al banquillo del club azulón.